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拓端tecdat|R语言里的非线性模型:多项式回归、局部样条、平滑样条、广义加性模型分析 ...

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏 邀请

原文链接:http://tecdat.cn/?p=9706

总览

在这里,我们放宽了流行的线性方法的假设。有时线性假设只是一个很差的近似值。有许多方法可以解决此问题,其中一些方法可以通过使用正则化方法降低模型复杂性来  解决  。但是,这些技术仍然使用线性模型,到目前为止只能进行改进。本文本专注于线性模型的扩展

  • 多项式回归    这是对数据提供非线性拟合的简单方法。

  • 阶跃函数  将变量的范围划分为  K个  不同的区域,以生成定性变量。这具有拟合分段常数函数的效果。

  • 回归样条  比多项式和阶跃函数更灵活,并且实际上是两者的扩展。 

  • 局部样条曲线  类似于回归样条曲线,但是允许区域重叠,并且可以平滑地重叠。

  • 平滑样条曲线  也类似于回归样条曲线,但是它们最小化平滑度惩罚的残差平方和准则 。

  • 广义加性模型  允许扩展上述方法以处理多个预测变量。

多项式回归

这是扩展线性模型的最传统方法。随着我们增加 多项式的项,多项式回归使我们能够生成非线性的曲线,同时仍使用最小二乘法估计系数。

逐步回归

它经常用于生物统计学和流行病学中。

回归样条

回归样条是 扩展多项式和逐步回归技术的许多基本函数之一  。事实上。多项式和逐步回归函数只是  函数的特定情况  。

这是分段三次拟合的示例(左上图)。

为了解决此问题,更好的解决方案是采用约束,使拟合曲线必须连续。

选择结的位置和数量

一种选择是在我们认为变化最快的地方放置更多的结,而在更稳定的地方放置更少的结。但是在实践中,通常以统一的方式放置结。

要清楚的是,在这种情况下,实际上有5个结,包括边界结。

那么我们应该使用多少个结?一个简单的选择是尝试许多个结,然后看哪个会产生最好的曲线。但是,更客观的方法是使用交叉验证。

与多项式回归相比,样条曲线可以显示出更稳定的效果。

平滑样条线

我们讨论了回归样条曲线,该样条曲线是通过指定一组结,生成一系列基函数,然后使用最小二乘法估计样条系数而创建的。平滑样条曲线是创建样条曲线的另一种方法。让我们回想一下,我们的目标是找到一些非常适合观察到的数据的函数,即最大限度地减少RSS。但是,如果对我们的函数没有任何限制,我们可以通过选择精确内插所有数据的函数来使RSS设为零。

选择平滑参数Lambda

同样,我们求助于交叉验证。事实证明,我们实际上可以非常有效地计算LOOCV,以平滑样条曲线,回归样条曲线和其他任意基函数。

平滑样条线通常比回归样条线更可取,因为它们通常会创建更简单的模型并具有可比的拟合度。

局部回归

局部回归涉及仅使用附近的训练观测值来计算目标点x 0 处的拟合度  。

可以通过各种方式执行局部回归,尤其是在涉及拟合p  线性回归模型的多变量方案中尤为明显  ,因此某些变量可以全局拟合,而某些局部拟合。

广义加性模型

 

GAM模型提供了一个通用框架,可通过允许每个变量的非线性函数扩展线性模型,同时保持可加性。

具有平滑样条的GAM并不是那么简单,因为不能使用最小二乘。取而代之的 是使用一种称为反向拟合的方法  。

GAM的优缺点

优点

  • GAM允许将非线性函数拟合到每个预测变量,以便我们可以自动对标准线性回归会遗漏的非线性关系进行建模。我们不需要对每个变量分别尝试许多不同的转换。

  • 非线性拟合可以潜在地对因变量Y做出更准确的预测  。

  • 因为模型是可加的,所以我们仍然可以检查每个预测变量对Y的影响,   同时保持其他变量不变。

缺点

  • 主要局限性在于该模型仅限于累加模型,因此可能会错过重要的交互作用。

 

范例

多项式回归和阶跃函数

  1.  
    library(ISLR)
  2.  
    attach(Wage)

我们可以轻松地使用来拟合多项式函数,然后指定多项式的变量和次数。该函数返回正交多项式的矩阵,这意味着每列是变量的变量的线性组合  age,  age^2,  age^3,和  age^4。如果要直接获取变量,可以指定  raw=TRUE,但这不会影响预测结果。它可用于检查所需的系数估计。

  1.  
    fit = lm(wage~poly(age, 4), data=Wage)
  2.  
    kable(coef(summary(fit)))

 

现在让我们创建一个ages 我们要预测的向量。最后,我们将要绘制数据和拟合的4次多项式。

  1.  
    ageLims <- range(age)
  2.  
    age.grid <- seq(from=ageLims[1], to=ageLims[2])
  3.  
     
  4.  
    pred <- predict(fit, newdata = list(age = age.grid),
  5.  
    se=TRUE)
  1.  
    plot(age,wage,xlim=ageLims ,cex=.5,col="darkgrey")
  2.  
    lines(age.grid,pred$fit,lwd=2,col="blue")
  3.  
    matlines(age.grid,se.bands,lwd=2,col="blue",lty=3)

在这个简单的示例中,我们可以使用ANOVA检验 。

  1.  
     
  2.  
    ## Analysis of Variance Table
  3.  
    ##
  4.  
    ## Model 1: wage ~ age
  5.  
    ## Model 2: wage ~ poly(age, 2)
  6.  
    ## Model 3: wage ~ poly(age, 3)
  7.  
    ## Model 4: wage ~ poly(age, 4)
  8.  
    ## Model 5: wage ~ poly(age, 5)
  9.  
    ## Res.Df RSS Df Sum of Sq F Pr(>F)
  10.  
    ## 1 2998 5022216
  11.  
    ## 2 2997 4793430 1 228786 143.59 <2e-16 ***
  12.  
    ## 3 2996 4777674 1 15756 9.89 0.0017 **
  13.  
    ## 4 2995 4771604 1 6070 3.81 0.0510 .
  14.  
    ## 5 2994 4770322 1 1283 0.80 0.3697
  15.  
    ## ---
  16.  
    ## Signif. codes: 0 \'***\' 0.001 \'**\' 0.01 \'*\' 0.05 \'.\' 0.1 \' \' 1

我们看到,_M_1 与二次模型  相比,p值  _M_2 实质上为零,这表明线性拟合是不够的。 因此,我们可以得出结论,二次方或三次模型可能更适合于此数据,并且偏向于简单模型。

我们也可以使用交叉验证来选择多项式次数。

 

在这里,我们实际上看到的最小交叉验证误差是针对4次多项式的,但是选择3次或2次模型并不会造成太大损失。接下来,我们考虑预测个人是否每年收入超过25万。

但是,概率的置信区间是不合理的,因为我们最终得到了一些负概率。为了生成置信区间,更有意义的是转换对    预测。

绘制:

  1.  
    plot(age,I(wage>250),xlim=ageLims ,type="n",ylim=c(0,.2))
  2.  
    lines(age.grid,pfit,lwd=2, col="blue")
  3.  
    matlines(age.grid,se.bands,lwd=1,col="blue",lty=3)

逐步回归函数

在这里,我们需要拆分数据。 

table(cut(age, 4))
  1.  
    ##
  2.  
    ## (17.9,33.5] (33.5,49] (49,64.5] (64.5,80.1]
  3.  
    ## 750 1399 779 72
  1.  
    fit <- lm(wage~cut(age, 4), data=Wage)
  2.  
    coef(summary(fit))

 

  1.  
    ## Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
  2.  
    ## (Intercept) 94.158 1.476 63.790 0.000e+00
  3.  
    ## cut(age, 4)(33.5,49] 24.053 1.829 13.148 1.982e-38
  4.  
    ## cut(age, 4)(49,64.5] 23.665 2.068 11.443 1.041e-29
  5.  
    ## cut(age, 4)(64.5,80.1] 7.641 4.987 1.532 1.256e-01

 

splines 样条函数

在这里,我们将使用三次样条。

由于我们使用的是三个结的三次样条,因此生成的样条具有六个基函数。 

  1.  
     
  2.  
    ## [1] 3000 6
  3.  
    dim(bs(age, df=6))
  4.  
     
  5.  
    ## [1] 3000 6
  6.  
    ## 25% 50% 75%
  7.  
    ## 33.75 42.00 51.00

拟合样条曲线。

 

我们也可以拟合平滑样条。在这里,我们拟合具有16个自由度的样条曲线,然后通过交叉验证选择样条曲线,从而产生6.8个自由度。

  1.  
     
  2.  
    fit2$df
  3.  
     
  4.  
    ## [1] 6.795
  5.  
    lines(fit, col=\'red\', lwd=2)
  6.  
    lines(fit2, col=\'blue\', lwd=1)
  7.  
    legend(\'topright\', legend=c(\'16 DF\', \'6.8 DF\'),
  8.  
    col=c(\'red\',\'blue\'), lty=1, lwd=2, cex=0.8)
  9.  
     

局部回归

执行局部回归。 

GAMs

现在,我们使用GAM通过年份,年龄和受教育程度的样条来预测工资。由于这只是具有多个基本函数的线性回归模型,因此我们仅使用  lm() 函数。

为了拟合更复杂的样条曲线 ,我们需要使用平滑样条曲线。

绘制这两个模型

 

year 是线性的。我们可以创建一个新模型,然后使用ANOVA检验 。

  1.  
     
  2.  
    ## Analysis of Variance Table
  3.  
    ##
  4.  
    ## Model 1: wage ~ ns(age, 5) + education
  5.  
    ## Model 2: wage ~ year + s(age, 5) + education
  6.  
    ## Model 3: wage ~ s(year, 4) + s(age, 5) + education
  7.  
    ## Res.Df RSS Df Sum of Sq F Pr(>F)
  8.  
    ## 1 2990 3712881
  9.  
    ## 2 2989 3693842 1 19040 15.4 8.9e-05 ***
  10.  
    ## 3 2986 3689770 3 4071 1.1 0.35
  11.  
    ## ---
  12.  
    ## Signif. codes: 0 \'***\' 0.001 \'**\' 0.01 \'*\' 0.05 \'.\' 0.1 \' \' 1

似乎添加线性year 成分要比不添加线性  成分的GAM好得多。 

  1.  
     
  2.  
    ##
  3.  
    ## Deviance Residuals:
  4.  
    ## Min 1Q Median 3Q Max
  5.  
    ## -119.43 -19.70 -3.33 14.17 213.48
  6.  
    ##
  7.  
    ## (Dispersion Parameter for gaussian family taken to be 1236)
  8.  
    ##
  9.  
    ## Null Deviance: 5222086 on 2999 degrees of freedom
  10.  
    ## Residual Deviance: 3689770 on 2986 degrees of freedom
  11.  
    ## AIC: 29888
  12.  
    ##
  13.  
    ## Number of Local Scoring Iterations: 2
  14.  
    ##
  15.  
    ## Anova for Parametric Effects
  16.  
    ## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
  17.  
    ## s(year, 4) 1 27162 27162 22 2.9e-06 ***
  18.  
    ## s(age, 5) 1 195338 195338 158 < 2e-16 ***
  19.  
    ## education 4 1069726 267432 216 < 2e-16 ***
  20.  
    ## Residuals 2986 3689770 1236
  21.  
    ## ---
  22.  
    ## Signif. codes: 0 \'***\' 0.001 \'**\' 0.01 \'*\' 0.05 \'.\' 0.1 \' \' 1
  23.  
    ##
  24.  
    ## Anova for Nonparametric Effects
  25.  
    ## Npar Df Npar F Pr(F)
  26.  
    ## (Intercept)
  27.  
    ## s(year, 4) 3 1.1 0.35
  28.  
    ## s(age, 5) 4 32.4 <2e-16 ***
  29.  
    ## education
  30.  
    ## ---
  31.  
    ## Signif. codes: 0 \'***\' 0.001 \'**\' 0.01 \'*\' 0.05 \'.\' 0.1 \' \' 1

在具有非线性关系的模型中,   我们可以再次确认year 对模型没有贡献。

接下来,我们 将局部回归拟合GAM  。

在调用GAM之前,我们还可以使用局部回归来创建交互项。

我们可以 绘制结果曲面图  。


参考文献 

1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例

2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现

3.matlab中的偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

4.R语言泊松Poisson回归模型分析案例

5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验

6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现

7.在R语言中实现Logistic逻辑回归

8.python用线性回归预测股票价格

9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

 


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