首先下载如下文件
fcgisetup32.msi   IIS中可以使用PHP的连接文件，在iis.net上可以下载到
php-5.2.6-Win32.zip   PHP的运行文件, 在php.net上可以下载到
phpMyAdmin-v2.116.rar   如果需要使用PHP管理MYSQL，可以下载这个开源的PHP管理MYSQL的环境，在sourceforge.net上可以下载到

首先安装fcgisetup32.msi，然后在IIS的站点（或者虚拟目录）的属性->“主目录”页签->配置->应用程序配置->应用程序扩展中添加对文件扩展名为.php的映射为D:\WINDOWS\system32\inetsrv\fcgiext.dll 
然后在D:\WINDOWS\system32\inetsrv下找到fcgiext.ini
修改节点[Types]如下：
[Types]
PHP=E:\PHP5\php\php-cgi.exe
[E:\PHP5\php\php-cgi.exe]
QueueLength=1000
MaxInstances=4
InstanceTimeout=30
InstanceMaxRequests=1000
其中E:\PHP5\php为php-5.2.6-Win32.zip的解压路径

最后新建一个扩展名为.php的文件就可以测试PHP是否被整合到IIS中了
<?php
echo phpinfo();
?>

下面开始配置phpmyadmin
1、首先配置php.ini，在E:\PHP5\php下找到php.ini-dist更名为php.ini，然后在文件中找到extension=php_mysql.dll，去掉前面的“;”，如果需要使用其它的扩展，也可以去掉相应扩展之前的";"，如extension=php_mssql.dll、extension=php_fdf.dll。然后将这个文件放到D:\WINDOWS下
2、在E:\PHP5\phpMyAdmin下找到config.sample.inc.php，更名为config.inc.php，其部分内容如下：
$cfg['blowfish_secret'] = 'hxh8201'; /* YOU MUST FILL IN THIS FOR COOKIE AUTH! */

/*
 * Servers configuration
 */
$i = 0;

/*
 * First server
 */
$i++;
// 显示在登陆屏幕上的服务器名字
$conf['servers'][0]['desc'] = 'MySQL';

/* Authentication type */
$cfg['Servers'][$i]['auth_type'] = 'cookie';
/* Server parameters */
// 服务器的主机名或IP地址。对于 UNIX domain socket 请使用 '' 。
// 对于本地 TCP/IP 链接请使用 'localhost' 。
$cfg['Servers'][$i]['host'] = 'localhost';
// 服务器的数据库链接端口(3306 是MySQL 的默认端口)
$conf['servers'][0]['port'] = 3306;
// SSL 链接选项: disable(禁止), allow(允许), prefer(首选), require(必须)
// $conf['servers'][0]['sslmode'] = 'allow';
// 更改仅在无法连接到 template1 的时候默认链接的数据库。
// 对于 PostgreSQL 8.1 以上版本的服务器，你需要将此处设为 'postgres'
// $conf['servers'][0]['defaultdb'] = 'template1';
$cfg['Servers'][$i]['connect_type'] = 'tcp';
$cfg['Servers'][$i]['compress'] = false;
/* Select mysqli if your server has it */
$cfg['Servers'][$i]['extension'] = 'mysql';
/* User for advanced features */
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] = 'root';
$cfg['Servers'][$i]['controlpass'] = 'hxh8201';

现在就可以通过PHPMYADMIN来管理您的MySql了。