• 设为首页
  • 点击收藏
  • 手机版
    手机扫一扫访问
    迪恩网络手机版
  • 关注官方公众号
    微信扫一扫关注
    迪恩网络公众号

GO分析和KEGG分析都是啥?

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏 邀请

几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析。那么GO和KEGG都是什么?富集分析又是个什么东西呢?

 

 

 

01

为什么做富集分析?

 

在我们进行差异表达分析的时候,我们会得到很多的差异表达基因。这些基因如果只是按照基因名放到哪里的话,我们很难找到一个规律说这些有基因之间有什么关系的。例如下图,我们把这些差异基因平铺来了之后,就是这么一个情况。

高通量的数据的分析,可以让我们得到很多候选的结果。但是如果只是把结果这样的平铺开的话,反正不利于我们去发现事情的本质。所以为了更情况的看清楚这些基因的功能,我们就使用了富集分析。我们可以把富集分析理解为在把很零零碎碎的东西,通过一个整体来反应出来,类似于从微观到宏观的变化。

利用富集分析,我们就可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。例如:TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、ATM、BCL2、BOK、CDKN1A这7个基因和胃癌的发生有关系。

 

 

剩余文章内容<<<<


鲜花

握手

雷人

路过

鸡蛋
该文章已有0人参与评论

请发表评论

全部评论

专题导读
热门推荐
热门话题
阅读排行榜

扫描微信二维码

查看手机版网站

随时了解更新最新资讯

139-2527-9053

在线客服(服务时间 9:00~18:00)

在线QQ客服
地址:深圳市南山区西丽大学城创智工业园
电邮:jeky_zhao#qq.com
移动电话:139-2527-9053

Powered by 互联科技 X3.4© 2001-2213 极客世界.|Sitemap