Python sdk.Visualization类代码示例

OGeek|极客世界-中国程序员成长平台 › 门户 › 编程› Python›Python编程经验

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏邀请

本文整理汇总了Python中qiime.sdk.Visualization类的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Visualization类的具体用法？Python Visualization怎么用？Python Visualization使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的类代码示例或许可以为您提供帮助。

在下文中一共展示了Visualization类的20个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于我们的系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_ne_same_data_different_uuid

    def test_ne_same_data_different_uuid(self):
        visualization1 = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())
        visualization2 = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())

        self.assertNotEqual(visualization1, visualization2)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:7，代码来源:test_visualization.py

示例2: test_load_and_save

    def test_load_and_save(self):
        fp1 = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization1.qzv')
        fp2 = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization2.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir,
                                                     self.provenance)
        visualization.save(fp1)

        visualization = Visualization.load(fp1)
        # Overwriting its source file works.
        visualization.save(fp1)
        # Saving to a new file works.
        visualization.save(fp2)

        with zipfile.ZipFile(fp1, mode='r') as zf:
            fps = set(zf.namelist())
            expected = {
                'visualization1/VERSION',
                'visualization1/metadata.yaml',
                'visualization1/README.md',
                'visualization1/data/index.html',
                'visualization1/data/css/style.css'
            }
            self.assertEqual(fps, expected)

        with zipfile.ZipFile(fp2, mode='r') as zf:
            fps = set(zf.namelist())
            expected = {
                'visualization2/VERSION',
                'visualization2/metadata.yaml',
                'visualization2/README.md',
                'visualization2/data/index.html',
                'visualization2/data/css/style.css'
            }
            self.assertEqual(fps, expected)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:34，代码来源:test_visualization.py

示例3: test_eq_same_uuid

    def test_eq_same_uuid(self):
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization1 = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())
        visualization1.save(fp)

        visualization2 = Visualization.load(fp)

        self.assertEqual(visualization1, visualization2)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:9，代码来源:test_visualization.py

示例4: test_load

    def test_load(self):
        saved_visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir, None)
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        saved_visualization.save(fp)

        visualization = Visualization.load(fp)

        self.assertEqual(visualization.type, qiime.core.type.Visualization)
        self.assertIsNone(visualization.provenance)
        self.assertEqual(visualization.uuid, saved_visualization.uuid)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:10，代码来源:test_visualization.py

示例5: test_get_index_paths_single_load

    def test_get_index_paths_single_load(self):
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir,
                                                     self.provenance)
        visualization.save(fp)
        visualization = Visualization.load(fp)

        actual = visualization.get_index_paths()
        expected = {'html': 'data/index.html'}
        self.assertEqual(actual, expected)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:10，代码来源:test_visualization.py

示例6: test_peek

    def test_peek(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir, None)
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qza')
        visualization.save(fp)

        metadata = Visualization.peek(fp)

        self.assertIsInstance(metadata, ResultMetadata)
        self.assertEqual(metadata.type, qiime.core.type.Visualization)
        self.assertIsNone(metadata.provenance)
        self.assertEqual(metadata.uuid, visualization.uuid)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:11，代码来源:test_visualization.py

示例7: test_ne_different_data_different_uuid

    def test_ne_different_data_different_uuid(self):
        visualization1 = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())

        data_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'mc-viz-output1')
        os.mkdir(data_dir)
        most_common_viz(data_dir,
                        collections.Counter(range(42)))
        visualization2 = Visualization._from_data_dir(
            data_dir, self.make_provenance_capture())

        self.assertNotEqual(visualization1, visualization2)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:12，代码来源:test_visualization.py

示例8: test_peek

    def test_peek(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization.save(fp)

        metadata = Visualization.peek(fp)

        self.assertIsInstance(metadata, ResultMetadata)
        self.assertEqual(metadata.type, 'Visualization')
        self.assertEqual(metadata.uuid, str(visualization.uuid))
        self.assertIsNone(metadata.format)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:12，代码来源:test_visualization.py

示例9: test_roundtrip

    def test_roundtrip(self):
        fp1 = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization1.qzv')
        fp2 = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization2.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())
        visualization.save(fp1)

        visualization1 = Visualization.load(fp1)
        visualization1.save(fp2)
        visualization2 = Visualization.load(fp2)

        self.assertEqual(visualization1.type, visualization2.type)
        self.assertEqual(visualization1.uuid, visualization2.uuid)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:13，代码来源:test_visualization.py

示例10: test_get_index_paths_multiple_html_load

    def test_get_index_paths_multiple_html_load(self):
        data_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'multi-html-viz1')
        os.mkdir(data_dir)
        multi_html_viz(data_dir, [1, 42])

        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(data_dir,
                                                     self.provenance)
        visualization.save(fp)
        visualization = Visualization.load(fp)

        with self.assertRaises(ValueError):
            visualization.get_index_paths()

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:13，代码来源:test_visualization.py

示例11: test_get_index_paths_multiple_load

    def test_get_index_paths_multiple_load(self):
        data_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'mc-viz-output1')
        os.mkdir(data_dir)
        most_common_viz(data_dir,
                        collections.Counter(range(42)))
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(data_dir,
                                                     self.provenance)
        visualization.save(fp)
        visualization = Visualization.load(fp)

        actual = visualization.get_index_paths()
        expected = {'html': 'data/index.html',
                    'tsv': 'data/index.tsv'}
        self.assertEqual(actual, expected)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:15，代码来源:test_visualization.py

示例12: inspect_visualization

def inspect_visualization(uuid):
    try:
        metadata = Visualization.peek(VISUALIZATIONS[uuid])
    except Exception:
        abort(404)

    return jsonify({'uuid': metadata.uuid, 'type': metadata.type})

开发者ID:robertoalvarezm，项目名称:qiime-studio，代码行数:7，代码来源:workspace.py

示例13: test_from_data_dir_with_provenance

    def test_from_data_dir_with_provenance(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir,
                                                     self.provenance)

        self.assertEqual(visualization.type, qiime.core.type.Visualization)
        self.assertEqual(visualization.provenance, self.provenance)
        self.assertIsInstance(visualization.uuid, uuid.UUID)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:7，代码来源:test_visualization.py

示例14: test_get_index_paths_single_from_data_dir

    def test_get_index_paths_single_from_data_dir(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir,
                                                     self.provenance)

        actual = visualization.get_index_paths()
        expected = {'html': 'data/index.html'}
        self.assertEqual(actual, expected)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:7，代码来源:test_visualization.py

示例15: test_from_data_dir

    def test_from_data_dir(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir, None)

        self.assertEqual(visualization.type, qiime.core.type.Visualization)
        self.assertIsNone(visualization.provenance)
        # We don't know what the UUID is because it's generated within
        # Visualization._from_data_dir.
        self.assertIsInstance(visualization.uuid, uuid.UUID)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:8，代码来源:test_visualization.py

示例16: test_get_index_paths_multiple_html_from_data_dir

    def test_get_index_paths_multiple_html_from_data_dir(self):
        data_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'multi-html-viz2')
        os.mkdir(data_dir)
        multi_html_viz(data_dir, [1, 42])

        visualization = Visualization._from_data_dir(
            data_dir, self.make_provenance_capture())

        with self.assertRaises(ValueError):
            visualization.get_index_paths()

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:10，代码来源:test_visualization.py

示例17: test_extract

    def test_extract(self):
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        visualization = Visualization._from_data_dir(self.data_dir,
                                                     self.provenance)
        visualization.save(fp)

        output_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'viz-extract-test')
        result_dir = Visualization.extract(fp, output_dir=output_dir)
        self.assertEqual(result_dir, output_dir)

        contents = [
            'visualization/VERSION',
            'visualization/metadata.yaml',
            'visualization/README.md',
            'visualization/data/index.html',
            'visualization/data/css/style.css']
        for fp in contents:
            expected_fp = os.path.join(output_dir, fp)
            self.assertTrue(os.path.exists(expected_fp),
                            'File %s was not extracted.' % fp)

开发者ID:Kleptobismol，项目名称:qiime2，代码行数:20，代码来源:test_visualization.py

示例18: test_get_index_paths_multiple_from_data_dir

    def test_get_index_paths_multiple_from_data_dir(self):
        data_dir = os.path.join(self.test_dir.name, 'mc-viz-output2')
        os.mkdir(data_dir)
        most_common_viz(data_dir, collections.Counter(range(42)))
        visualization = Visualization._from_data_dir(
            data_dir, self.make_provenance_capture())

        actual = visualization.get_index_paths()
        expected = {'html': 'data/index.html',
                    'tsv': 'data/index.tsv'}
        self.assertEqual(actual, expected)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:11，代码来源:test_visualization.py

示例19: test_load_visualization

    def test_load_visualization(self):
        saved_visualization = Visualization._from_data_dir(
             self.data_dir, self.make_provenance_capture())
        fp = os.path.join(self.test_dir.name, 'visualization.qzv')
        saved_visualization.save(fp)

        visualization = Result.load(fp)

        self.assertIsInstance(visualization, Visualization)
        self.assertEqual(visualization.type, qiime.core.type.Visualization)
        self.assertEqual(visualization.uuid, saved_visualization.uuid)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:11，代码来源:test_result.py

示例20: test_ne_different_type_same_uuid

    def test_ne_different_type_same_uuid(self):
        visualization = Visualization._from_data_dir(
            self.data_dir, self.make_provenance_capture())

        class Faker:
            @property
            def uuid(self):
                return visualization.uuid

        faker = Faker()

        self.assertNotEqual(visualization, faker)

开发者ID:qiime2，项目名称:qiime2，代码行数:12，代码来源:test_visualization.py

注：本文中的qiime.sdk.Visualization类示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等源码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。

鲜花

握手

雷人

路过

鸡蛋

该文章已有0人参与评论

请发表评论

全部评论

专题导读

More+

10-27 六六分期app的软件客服如何联系？(六六分期

11-06 可心卡盟:win10系统火狐flash插件崩溃怎么

11-06 亲亲特价:怎么删除回收站图标

11-06 济南大学虚拟社区:鲁大师节能降温的具体办

11-06 xlueops.exe:无线网络安装向导

11-06 女斗合众国:win7系统cf与主机连接不稳定怎

11-06 0xc000022-[cf烟雾头]cf怎么调烟雾头

11-06 qizideyouhuo:应用程序无法正常启动0xc0000

11-06 ipz-185:win7系统vcf文件怎么打开

11-06 傻哥蹦迪:win10系统s4怎么打开usb调试

11-06 八神浩树gtaste:回收站清空了怎么恢复

11-06 妖尾之黑色守护:win10系统电脑没有1440x900

11-06 校园至尊魔王小说:win7系统浏览网页时字体

11-06 女斗合众国:win10系统访问共享文件夹提示请

11-06 tokyo hot n0654:恢复win7系统默认字体一招

11-06 雨酷仙境:设置win7系统转移临时文件夹腾出

11-06 阿穆纳伊之杖:win7系统开始菜单在右边还原

11-06 tunespotting:win10系统火狐flash插件总是

11-06 甘尔葛分析师：计谋网站seo关键词暴涨有什

11-06 蔡贵霖: 计谋网站seo关键词暴涨有什么秘密

11-06 博益网首页:ao3网页版进入不了解决方法

11-06 漏斗子专栏: 网站数据分析小白易懂精华篇

11-06 见证双虹怎么做:win7系统开启telnet命令的

11-06 颾狐蝶蜋:系统资源不足无法完成请求的服务

11-06 国光中学校歌:提交网站到alexa查询详细步骤

11-06 西安有情天:静态网页和动态网页的区别

11-06 红木雅尚斋:外部链接构造对网站的好处

11-06 前官礼遇：防止域名劫持–增强域安全性的10

11-06 密传二转答案: 中文分词算法有哪些

11-06 金泉家园邮编:百度快照劫持的表现及应对方

Python sort.natsort函数代码示例发布时间：2022-05-26

Python sdk.Artifact类代码示例发布时间：2022-05-26

Python util.grid_equal函数代码示例

1 Python 入门教程

Python入门教程 Python 是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。 P

阅读：13789|2022-01-22

2 Python wikiutil.getFrontPage函数代码示例

Python wikiutil.getFrontPage函数代码示例

阅读：10177|2022-05-24

3 Python 简介

Python 简介 Python 是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本

阅读：4076|2022-01-22

4 Python tests.group函数代码示例

Python tests.group函数代码示例

阅读：4039|2022-05-27

5 Python util.check_if_user_has_permission

Python util.check_if_user_has_permission函数代码示例

阅读：3832|2022-05-27

6 Python 操练实例98

Python 练习实例98 Python 100例题目：从键盘输入一个字符串，将小写字母全部转换成大

阅读：3508|2022-01-22

7 Python 环境搭建

Python 环境搭建本章节我们将向大家介绍如何在本地搭建 Python 开发环境。 Py

阅读：3029|2022-01-22

8 Python output.darkgreen函数代码示例

Python output.darkgreen函数代码示例

阅读：2646|2022-05-25

9 Python 基础语法

Python 基础语法 Python 语言与 Perl，C 和 Java 等语言有许多相似之处。但是，也

阅读：2636|2022-01-22

10 Python 中文编码

Python 中文编码前面章节中我们已经学会了如何用 Python 输出 Hello, World!，英文没

阅读：2293|2022-01-22

客服电话

电子邮件

Python sdk.Visualization类代码示例

示例1: test_ne_same_data_different_uuid

示例2: test_load_and_save

示例3: test_eq_same_uuid

示例4: test_load

示例5: test_get_index_paths_single_load

示例6: test_peek

示例7: test_ne_different_data_different_uuid

示例8: test_peek

示例9: test_roundtrip

示例10: test_get_index_paths_multiple_html_load

示例11: test_get_index_paths_multiple_load

示例12: inspect_visualization

示例13: test_from_data_dir_with_provenance

示例14: test_get_index_paths_single_from_data_dir

示例15: test_from_data_dir

示例16: test_get_index_paths_multiple_html_from_data_dir

示例17: test_extract

示例18: test_get_index_paths_multiple_from_data_dir

示例19: test_load_visualization

示例20: test_ne_different_type_same_uuid

请发表评论

全部评论

上一篇：

下一篇：

Python util.grid_equal函数代码示例

Python util.get_worker_name函数代码示例

Python util.get_webmention_target函数代

Python util.get_uuid函数代码示例

Python util.get_type_by_name函数代码示例

Python util.grid_equal函数代码示例

Python util.get_worker_name函数代码示例

Python util.get_webmention_target函数代

Python util.get_uuid函数代码示例

Python util.get_type_by_name函数代码示例

Python util.get_stdout函数代码示例

关于我们

产品与服务

解决方案

139-2527-9053